La resistencia a los antifúngicos se ha convertido en una amenaza creciente para la salud pública mundial, y recientemente ha sido añadida a la lista de prioridades sanitarias de la Organización Mundial de la Salud (OMS). A pesar de su relevancia, los hongos han recibido menos atención que las bacterias en los programas de vigilancia y desarrollo de medicamentos, lo que resulta preocupante dado su impacto clínico y las pérdidas significativas que provocan en la agricultura.
Aunque el avance en la secuenciación masiva de ADN ha permitido progresos notables en el estudio del microbioma y la resistencia a antibióticos, la investigación sobre la resistencia a antifúngicos enfrenta desafíos considerables. La falta de bases de datos exhaustivas y referencias adecuadas, junto con la complejidad del genoma eucariótico, complican el análisis in silico a gran escala.
Nueva base de datos para combatir la resistencia
Con el objetivo de abordar esta problemática, un equipo internacional liderado por el Instituto de Biología Funcional y Genómica (IBFG, CSIC–USAL), junto con la Universidad de Salamanca y la Université Laval (Canadá), ha desarrollado FungAMR. Esta base de datos contiene más de 50.000 entradas y 35.000 mutaciones genéticas identificadas en 95 especies de hongos, relevantes tanto desde una perspectiva clínica como agrícola y ambiental. Las mutaciones están asociadas a 246 proteínas, que confieren resistencia a un total de 208 antifúngicos.
La información recopilada proviene manualmente de más de 500 estudios científicos, clasificada rigurosamente según el nivel de evidencia experimental. Esto permite a los usuarios evaluar la fiabilidad y respaldo científico detrás de cada mutación. El investigador Christian R. Landry, de la Université Laval, subraya que “la motivación detrás de FungAMR era crear una base de datos exhaustiva y confiable sobre mecanismos de resistencia a antifúngicos”. La interfaz web amigable facilita su uso.
Innovaciones en bioinformática
Aparte del desarrollo de FungAMR, el equipo también ha creado ChroQueTas, un software pionero en bioinformática que permite analizar genomas y proteomas fúngicos para detectar automáticamente mutaciones relacionadas con resistencia a antifúngicos. Este software libre está diseñado para realizar cribados genéticos rápidos, precisos y escalables en cepas clínicas y ambientales.
Narciso M. Quijada, investigador del IBFG, destaca que durante las pruebas realizadas con genomas previamente publicados, ChroQueTas no solo reportó las mutaciones ya descritas sino que también identificó nuevas mutaciones no documentadas anteriormente. Esto demuestra su potencial como herramienta clave para la vigilancia genómica.
Peligros asociados a la resistencia cruzada
El estudio revela que muchas mutaciones pueden conferir resistencia a múltiples antifúngicos simultáneamente, fenómeno conocido como resistencia cruzada. Este problema surge principalmente debido al uso masivo de antifúngicos en agricultura, especialmente azoles, lo que representa una presión evolutiva significativa. Tal situación complica el tratamiento eficaz de infecciones fúngicas y resalta la urgente necesidad de desarrollar nuevas terapias con mecanismos alternativos.
La noticia en cifras
Cifra |
Descripción |
50,000+ |
Entradas en la base de datos FungAMR |
35,000 |
Mutaciones genéticas identificadas |
95 |
Especies de hongos de interés clínico, agrícola y ambiental |
246 |
Proteínas asociadas a la resistencia |
208 |
Antifúngicos a los que confieren resistencia |
Preguntas sobre la noticia
¿Qué es FungAMR?
FungAMR es una base de datos que recopila más de 50.000 entradas y 35.000 mutaciones genéticas identificadas en 95 especies de hongos, asociadas a 246 proteínas que confieren resistencia a un total de 208 antifúngicos.
¿Cuál es el objetivo de la creación de FungAMR?
El objetivo de FungAMR es proporcionar una base de datos exhaustiva, detallada y fiable sobre los mecanismos de resistencia a antifúngicos, facilitando así la investigación y el desarrollo de nuevas terapias.
¿Qué herramienta ha desarrollado el equipo junto con FungAMR?
El equipo ha desarrollado ChroQueTas (Chromosome Query Targets), una herramienta bioinformática que permite analizar genomas y detectar automáticamente mutaciones que confieren resistencia a antifúngicos.
¿Cómo se puede acceder a FungAMR y ChroQueTas?
FungAMR está disponible como interfaz web dentro del portal del Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD), mientras que ChroQueTas está disponible como software de código abierto en GitHub.
¿Por qué es importante abordar la resistencia a los antifúngicos?
La resistencia a los antifúngicos es una amenaza creciente para la salud global, ya que dificulta el tratamiento de infecciones fúngicas y puede provocar pérdidas significativas en cultivos agrícolas.